Serggio (asker) Apr 13, 2020:

Спасибо всем участникам, все ваши посты были очень полезны

Igor Andreev Apr 13, 2020:

Нужно просто в скобках написать "scaffolding" - и всем всё будет понятно.
;-)

Natalie Apr 13, 2020:

А говоря о ДНК-скаффолдах вы тоже напишете "мультикомплексы контигов" или как? :-)
Не зря же ввели специальный термин scaffold, scaffolding, а не пишут про "multi... complexes".
Нужно просто в скобках написать "scaffolding" - и всем всё будет понятно.

Igor Andreev Apr 13, 2020:

The advantage of scaffolds over direct fuses lies in preserving the enzyme amino acid sequences intact

попробуйте здесь перевести просто как преимущество каркасов по сравнению со слитыми белками, и как потом догадаться, что речь о создании мультиферментных комплексов на основе каркасных молекул по сравнению с созданием слитых белков?

Igor Andreev Apr 13, 2020:

Натали, я с Вами согласен в отношении scaffold и scaffold proteins, и совершенно не пытаюсь спорить, но в данном контексте я понимаю процесс scaffolding, как описал ниже.

Кстати, scaffoldING proteins в некоторых случаях возможно имело бы смысл переводить как каркасообразующие белки, - просто мысль вслух без всяких претензий )

Natalie Apr 13, 2020:

Игорь: Определение из толкового словаря
scaffolding
a temporary structure on the outside of a building, made of wooden planks and metal poles, used by workmen while building, repairing, or cleaning the building.
И еще много аналогичных определений в разных словарях - https://tinyurl.com/wmedugv

По-русски - это дословно "строительные леса". Теперь что касается биологии вообще и сигнальных путей в частности:
What is a scaffolding protein and why is it important?
In biology, scaffold proteins are crucial regulators of many key signalling pathways. Although scaffolds are not strictly defined in function, they are known to interact and/or bind with multiple members of a signalling pathway, tethering them into complexes.

И еще:
What is a molecular scaffold?
The scaffold concept is widely applied in medicinal chemistry. Scaffolds are mostly used to represent core structures of bioactive compounds. ... In general terms, a “scaffold” is best understood as a molecular core to which functional groups are attached.

Иными словами, эти белки образуют каркас (матрицу), удерживающую в комплексе все компоненты того или иного сигнального пути.

Igor Andreev Apr 13, 2020:

Fuses:, да, но в одном из случаев перевел бы для разнообразия как создание химерных/гибридных/слитых белков

В целом, если позволяет ситуация, попробовал бы использовать "компромиссный" описательный вариант перевода: формирование/создание [надмолекулярных] ферментных комплексов на каркасе из белковых или других молекул

Serggio (asker) Apr 13, 2020:

fusion &fuses Правильно ли я понимаю, что "fusion" в 1-ой фразе и "fuses" во второй означают в данном контексте одно и то же понятие "слияние" (белков)?

Serggio (asker) Apr 13, 2020:

Spatial proximity of the enzyme active sites may increase the total rate of heterologous metabolite conversion and decrease the intermediate efflux and can be achieved by direct protein fusion or scaffolding. The advantage of scaffolds over direct fuses lies in preserving the enzyme amino acid sequences intact, which is generally better for protein function. Three major scaffold types include DNA-scaffold, which is based on plasmids and allows to easily change the distance between interacting proteins, RNA-scaffold, that possess the advantage of small size, or protein scaffold, the wide range of which is available.

Serggio (asker) Apr 13, 2020:

естественные процессы или биотехнология? Игорь, насколько понимаю, биотехнология "...essential techniques of creating heterologous biochemical pathways in various host organisms".
Вот самый полный контекст:

Igor Andreev Apr 12, 2020:

Натали,
а как же ферменты, они не участвуют в этом scaffolding? А как же тогда достигается Spatial proximity of the enzyme active sites?
Сам по себе белковый каркас, как в случае ядерного матрикса или клеточного цитоскелета, ничего не даст, надо, чтобы в него были встроены еще различные ферменты.
Если это пассивная синтетическая матрица, к которой можно пришивать ферменты, да, согласен - каркас. Но это могут быть и специфические белковые взаимодействия, как в живой клетке, где белковые и небелковые молекулы, имеющие разные функции, взаимодействуют в строго определенном соотношении и количестве, образуя вполне определенные пространственные структуры и тогда речь именно о комплексах.

Natalie Apr 12, 2020:

Игорь, это не имеет значения - см. все ту же ссылку, которую я привела. Я процитировала только часть, которая касается естественных процессов. Но дальше там написано: "Synthetic protein scaffolding is increasingly used as a mechanism to improve product specificity and yields in metabolic engineering projects. To date, synthetic scaffolding has focused primarily on soluble enzyme systems, but many metabolic pathways for high-value secondary metabolites depend on membrane-bound enzymes."

Так что формирование белковых каркасов имеет место быть и там, и там.

Что касается просто "надмолекулярных белковых комплексов" - то это более общее понятие, чем "каркасы" (даже из приведенного описания видно, что термин "scaffolding" объясняется с помощью "надмолекулярных комплексов"). Белок-белковые комплексы могут выполнять всевозможные функции, тогда как под белковым скаффолдингом понимается прежде всего формирование структурного каркаса.

Igor Andreev Apr 12, 2020:

Вопрос, в переводимом тексте описаны естественные процессы в клетке или некие биотехнологические подходы?
В первом случае, смущает "слияние белков"...

Tatiana Bobritsky (X) Apr 12, 2020:

Обычно в публикациях встречается "каркасные белки" и "структурные белки". Они выполняют именно механические и структурные функции, выстраивая цитоскелет. А процесс поддерживания, кмк, предполагает более широкое толкование.

Serggio (asker) Apr 12, 2020:

Можно еще ликбез:
каркасные белки = поддерживающие белки?

Serggio (asker) Apr 12, 2020:

Ирина, спасибо, идея хорошая. Но авторы - этнические русские (м.б. переводил американец, но ссылок на него нет :-)

IrinaN Apr 12, 2020:

Бейте врага его оружием Тенденция американцев превращать существительные в глаголы широко известна. Попробуйте наоборот:
Не знаю, можно ли так с научной точки зреия, я вообще не знаю, как составить предложение, но лингвистически вполне может быть "использование белков слияния и поддерживающих белков". Если Вам понятен сам процесс, поиграйте с такой конструкцией.