"Throw oneself in at the deep end" es una frase hecha, basada, evidentemente, en la idea de lanzarse a la parte más profunda de la piscina. Expresa la idea de meterse sin preparación adecuada en una situación difícil. Es más frecuente "throw someone in at the deep end" o "be thrown in at the deep end":

"throw (someone) in at the deep end
to put (someone) into a new situation, job, etc., without preparation or introduction"
http://www.thefreedictionary.com/end

Creo que la idea de meterse de golpe en una actividad sin preparación podría expresarse por "lanzarse a la buena de Dios", y podría interpretarse así.

Sin embargo, en este caso creo que "deep end" recalca sobre todo la idea de afrontar de entrada los aspectos más complicados de una actividad, en vez de empezar por lo más fácil; por eso, dice "only to struggle", que significa "pasar apuros", "encontrarse apurado". No se me ocurre una frase hecha que exprese exactamente esta idea. Así pues, propongo la primera versión.

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Note added at 7 hrs (2013-09-19 08:05:22 GMT)
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"Meterse de entrada en camisa de once varas" es otra posibilidad que podría servirnos. Pero la idea de "deep end" no es exactamente meterse en un lío, sino meterse de manera prematura en algo que supera nuestras capacidades, para lo que no estamos preparados.