Dec 13, 2016 19:00
7 yrs ago
1 viewer *
English term
ambiguity code
English to Polish
Science
Genetics
The meaning of the letters such as N, B, S or K is defined by the IUPAC nucleotide ambiguity code.
Proposed translations
(Polish)
4 | kod IUPAC dla nukleotydów zdegenerowanych | Marceli Ragan |
3 | degeneracja kodu genetycznego/nadmiarowość kodu genetycznego, | Frank Szmulowicz, Ph. D. |
Proposed translations
15 hrs
Selected
kod IUPAC dla nukleotydów zdegenerowanych
Zgodnie z kodem IUPAC motyw ten można zapisać jako sekwencje „STATAWARRSSSS”
gdzie S = G lub C; W = A lub T; R = A lub G.
http://www.cellab.polsl.pl/resources/Rozprawa_doktorska_Jaks...
W sekwencji otrzymanej w wyniku sekwencjonowania moich próbek znajdują się litery inne niż A, C, T, G. Co one oznaczają?
Są to symbole zdegenerowanych zasad. Oznacza to, że w próbce przysłąnej do sekwencjonowania znajduje się więcej niż jeden rodzaj cząsteczek DNA, różniących sie zasadą oznaczoną takim symbolem. Jest to tzw. kod IUPAC.
Kod
IUPAC nukleotyd w
sekwencji
M A lub C
R A lub G
W A lub T
S C lub G
Y C lub T
K G lub T
N A lub C lub G lub T
http://www.genomed.pl/index.php/pl/faq
Drugi typ to tzw. nukleotydy zdegenerowane, które potrafią hybrydyzować z więcej
niż z jednym nukleotydem. Wśród nich można wyróżnić nukleotydy:
❼ silne, oznaczane literą S, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami C i G,
❼ słabe, oznaczane literą W, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami A i T,
❼ purynowe, oznaczane literą R, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami A i G,
❼ pirymidynowe, oznaczane literą Y, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami C i T
http://repozytorium.put.poznan.pl/Content/297669/Kamil_Julia...
gdzie S = G lub C; W = A lub T; R = A lub G.
http://www.cellab.polsl.pl/resources/Rozprawa_doktorska_Jaks...
W sekwencji otrzymanej w wyniku sekwencjonowania moich próbek znajdują się litery inne niż A, C, T, G. Co one oznaczają?
Są to symbole zdegenerowanych zasad. Oznacza to, że w próbce przysłąnej do sekwencjonowania znajduje się więcej niż jeden rodzaj cząsteczek DNA, różniących sie zasadą oznaczoną takim symbolem. Jest to tzw. kod IUPAC.
Kod
IUPAC nukleotyd w
sekwencji
M A lub C
R A lub G
W A lub T
S C lub G
Y C lub T
K G lub T
N A lub C lub G lub T
http://www.genomed.pl/index.php/pl/faq
Drugi typ to tzw. nukleotydy zdegenerowane, które potrafią hybrydyzować z więcej
niż z jednym nukleotydem. Wśród nich można wyróżnić nukleotydy:
❼ silne, oznaczane literą S, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami C i G,
❼ słabe, oznaczane literą W, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami A i T,
❼ purynowe, oznaczane literą R, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami A i G,
❼ pirymidynowe, oznaczane literą Y, zdolne do hybrydyzacji z nukleotydami C i T
http://repozytorium.put.poznan.pl/Content/297669/Kamil_Julia...
4 KudoZ points awarded for this answer.
9 hrs
degeneracja kodu genetycznego/nadmiarowość kodu genetycznego,
Degenerate base symbols in biochemistry are an IUPAC[2] representation for a position on a DNA sequence that can have multiple possible alternatives. These should not be confused with non-canonical bases because each particular sequence will have in fact one of the regular bases. These are used to encode the consensus sequence of a population of aligned sequences and are used for example in phylogenetic analysis to summarise into one multiple sequences or for BLAST searches, even though IUPAC degenerate symbols are masked (as they are not coded).
Under the commonly used IUPAC system, nucleobases are represented by the first letters of their chemical names: [G]uanine, [C]ytosine, [A]denine, and [T]hymine.[1] This shorthand also includes eleven "ambiguity" characters associated with every possible combination of the four DNA bases.[3] The ambiguity characters were designed to encode positional variations found among families of related genes. The IUPAC notation, including ambiguity characters and suggested mnemonics, is shown in Table 1.
https://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation
ccc
Zdegenerowany
64 kodony kodują tylko 20 aminokwasów. Dlatego kolejną cechą kodu jest jego degeneracja. Kod jest zdegenerowany, co oznacza, że jeden aminokwas może być kodowany przez kilka kodonów. Zatem jeden aminokwas może być kodowany przez jeden, dwa, trzy, cztery, nawet 6 trójek (leucyna). Lecz nie oznacza to, że dany kodon może kodować więcej niż jeden aminokwas. Np. alanina kodowana jest przez następujące trójki : GAG, GAA, GAC, GAU.
http://www.biologia.net.pl/genetyka/kod-genetyczny.html
cccccccccccccccc
Polega na degeneracja kodu genetycznego polega na tym, że jeden aminokwas może być kodowany przez różne kodony (trójki nukleotydów), np. seryna jest kodowana przez 6 różnych kodonów: UCU, UCC, UCA, UCG, AGU i AGC.
http://zapytaj.onet.pl/Category/006,001/2,21861613,Na_czym_p...
cccccccccccccccccc
degeneracja kodu genetycznego, nadmiarowość kodu genetycznego, przejawiająca się tym, że określony aminokwas jest kodowany przez więcej niż jeden kodon (kodony synonimiczne).
http://encyklopedia.pwn.pl/haslo/degeneracja-kodu-genetyczne...
Under the commonly used IUPAC system, nucleobases are represented by the first letters of their chemical names: [G]uanine, [C]ytosine, [A]denine, and [T]hymine.[1] This shorthand also includes eleven "ambiguity" characters associated with every possible combination of the four DNA bases.[3] The ambiguity characters were designed to encode positional variations found among families of related genes. The IUPAC notation, including ambiguity characters and suggested mnemonics, is shown in Table 1.
https://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_notation
ccc
Zdegenerowany
64 kodony kodują tylko 20 aminokwasów. Dlatego kolejną cechą kodu jest jego degeneracja. Kod jest zdegenerowany, co oznacza, że jeden aminokwas może być kodowany przez kilka kodonów. Zatem jeden aminokwas może być kodowany przez jeden, dwa, trzy, cztery, nawet 6 trójek (leucyna). Lecz nie oznacza to, że dany kodon może kodować więcej niż jeden aminokwas. Np. alanina kodowana jest przez następujące trójki : GAG, GAA, GAC, GAU.
http://www.biologia.net.pl/genetyka/kod-genetyczny.html
cccccccccccccccc
Polega na degeneracja kodu genetycznego polega na tym, że jeden aminokwas może być kodowany przez różne kodony (trójki nukleotydów), np. seryna jest kodowana przez 6 różnych kodonów: UCU, UCC, UCA, UCG, AGU i AGC.
http://zapytaj.onet.pl/Category/006,001/2,21861613,Na_czym_p...
cccccccccccccccccc
degeneracja kodu genetycznego, nadmiarowość kodu genetycznego, przejawiająca się tym, że określony aminokwas jest kodowany przez więcej niż jeden kodon (kodony synonimiczne).
http://encyklopedia.pwn.pl/haslo/degeneracja-kodu-genetyczne...
Something went wrong...